Важным инструментом юридической поддержки членов Российского Зернового Союза является Третейский суд РЗС. Как первым Уставом Зернового союза от 18 августа 1994 г., так и его действующей редакцией, утвержденной в 2008 году, предусмотрено, что одним из направлений деятельности Российского Зернового Союза является организация процедуры внутреннего арбитрирования. Для реализации этой цели и был создан Третейский суд РЗС, в который могут обращаться как члены РЗС, так и не входящие в Союз организации. Третейский суд РЗС стал одним из важных и эффективных проектов, так как его деятельность полностью соответствует интересу членов РЗС и иных игроков зернового и смежных рынков, объективному и высококвалифицированному рассмотрению возникающих споров.
  Преимущества и смысл рассмотрения споров по коммерческим операциям участников зернового и смежных рынков Третейским судом РЗС состоят, как показывает практика, в том, что в заседаниях принимают участие не только профессиональные юристы, но и высококвалифицированные специалисты зернового рынка, эксперты, которые хорошо представляют все особенности производства, хранения и торговли зерном, хлебопродуктами, комбикормами. Большой опыт работы в сфере рынка зерна позволяет членам Третейского суда РЗС более квалифицированно и со знанием специфики дела подходить к разрешению тех или иных спорных ситуаций, возникающих при производстве, сертификации, торговле зерновыми, масличными, продуктами их переработки.
Другим преимуществом рассмотрения споров в Третейском суде РЗС является существенное снижение издержек на ведение судебного процесса. Ставки Третейского суда РЗС существенно ниже размеров государственной пошлины за рассмотрение дел в государственных арбитражных судах.
  В пользу более широкого применения разрешения споров Третейским судом РЗС также говорят оперативность и скорость рассмотрения дел (не более двух месяцев с даты образования состава третейского суда по конкретному делу). Установление более коротких сроков практически нецелесообразно, т.к. это лишает стороны возможности полноценно защищать свои интересы в Третейском суде.